钱学森晚年提倡研究神学的原因主要有以下几点：
科学与宗教关系的思考：
钱学森晚年对科学与宗教之间的关系进行了深刻的思考和探索。他认为，尽管科学和技术的发展极大地改变了人类的生活和世界观，但它们并没有完全解释宇宙和生命的奥秘。钱学森意识到，现代科学在探索自然规律时，往往会忽略人类的情感和精神层面，而这些层面对于人类的生存和发展也是至关重要的。
寻求更深层次的思考和指引：
钱学森认为，神学可以为科学提供更深层次的思考和指引，帮助人类更好地认识自己和世界。他希望通过研究神学，能够从更宏观的角度审视科学和宗教的关系，探索神学和科学的交叉领域，以期更好地理解宇宙和生命的本质。
对科学边界的探索：
钱学森在长期科研生涯中，深刻认识到科学的进步在于不断突破已知，拓展认知疆土。他发现，当科学家登上一座高山后，却发现神学家早已坐在那里了。这种体验可能促使他进一步思考科学的极限和未知的世界，从而转向神学研究。
个人信仰与兴趣：
钱学森对特异功能和气功等神秘现象产生了浓厚的兴趣，部分源于他对科学边界的不懈探索精神。他相信，特异功能可能是科学尚未揭示的领域之一，值得深入研究和探索。
综上所述，钱学森晚年提倡研究神学，是他对科学与宗教之间关系的深刻思考和探索，也是他希望通过神学的研究为科学提供更深层次的思考和指引，帮助人类更好地认识自己和世界。尽管这一研究方向在当时引起了广泛的讨论和争议，但钱学森依然坚持自己的信念，并认为神学研究具有重要的意义。