林徽因死后没有与梁思成葬在一起的原因主要有以下几点：
身份不同：
梁思成属于国家领导人，八宝山有专门为国家领导人设立的骨灰室，而林徽因并没有这样的待遇。因此，她最终被安葬在八宝山革命烈士公墓。
再娶的争议：
梁思成在林徽因去世后，与林洙结婚，这在某种程度上违背了他与林徽因的诺言。因此，他选择将林徽因安葬在八宝山墓地区，而自己则葬在骨灰室区，以避免外界的非议。
现实情况：
林徽因去世后，她的遗体被葬在了八宝山革命烈士公墓，而梁思成则因为身份特殊，被安置在专门的骨灰堂里。尽管两人葬在八宝山，但实际上是分开的。
综上所述，林徽因和梁思成没有合葬的原因主要是身份不同以及梁思成再娶的争议。尽管他们两人都是中国近现代史上的杰出人物，但他们的身后事却因为这些现实问题而无法合葬在一起。