《还珠格格》的主要思想包括以下几个方面：
批判封建等级制度：
该剧通过小燕子和紫薇等角色的故事，对封建等级制度进行了批判。小燕子要求太监宫女与她平起平坐，这种对平等的渴望和追求，反映了当时社会底层人民的心声，也具有一定的现实意义。
追求自由平等：
小燕子和紫薇来自民间，她们将平等的思想带入宫廷，与传统的封建礼教产生了强烈的冲突。这种对自由和平等的追求，是该剧的重要主题之一。
歌颂真挚的爱情、友情和亲情：
剧中几对年轻人之间的爱情故事，如永琪与小燕子、尔康与紫薇，他们冲破重重阻碍，最终走到一起，展现了爱情的力量和美好。
反对封建婚姻制度和家长制度：
剧中通过小燕子和尔康、紫薇和福伦等角色的故事，揭示了封建婚姻制度和家长制度的弊端，表现了主人公们因反对这些制度而经历的种种困境和抉择。
表达反封建的思想：
琼瑶在构思这个故事时，不仅单纯为了写一个阴差阳错的故事，更是为了表达自己反封建的思想。她通过剧中的细节，如小燕子不断引用《礼运 大同篇》中的话，表达了反对封建思想和传统观念，勇敢追求个人幸福。
展现个人意志与自由的重要性：
琼瑶认为，《还珠格格》不仅是一部古装情感剧，更是一封青春浪漫的情书，它融合了爱情、友情、忠诚与叛逆，以独特的视角展现了封建皇权下小人物的不屈与坚持。她希望通过这些故事传达出个人的意志与自由的重要性，即使是在重重束缚的古代背景下，这份对自由的渴望依旧照亮人心。
综上所述，《还珠格格》通过其丰富的故事情节和深刻的主题思想，不仅展现了对封建等级制度和礼教的批判，还歌颂了真挚的爱情、友情和亲情，表达了反封建的思想和对个人自由、幸福的追求。这些主题使得该剧在播出时深受观众喜爱，并在今天仍然具有现实意义。