六字真言的不同读音主要源于以下几个方面：
历史传承与注音方法的变迁
明清以前，六字真言的读音主要靠已知之字音互切而说明，没有统一的汉字注音方法，导致人们对六字诀发音产生歧义，出现了“同字不同音，同音不同字”的现象。
不同流派与地区的读法
六字真言在流传过程中，不同的流派和地区有不同的读法。例如，“呵”字在“养气功六字诀”中读“kē”，在“峨眉派”中读“hā（哈）”，在“六字真言”中读“hē”。
梵文发音的音译
六字真言是梵文发音，国内几个发音版本虽然不一样，但都相近。梵文中的Om音译为“唵：[ǎn] 嘛：[má] 呢：[ní] 叭：[bā] 咪：[mī] 哞：[mōu]”，但在汉传佛教中，通常被读成安（an）的音，这可能是由于传承中的混淆或其他原因。
专家意见的不统一
对于某些字的读音，如“呬”字，有的专家认为应读“si”，或四声降调“sì”，或一声平调“嘶sī”；而有的专家则认为应读“xì（戏）”。
建议
统一读音：虽然六字真言的读音存在差异，但为了便于传承和修行，建议参考权威文献和专家意见，尽量统一读音。
了解背景：学习六字真言时，了解其历史背景和不同流派的读法，有助于更准确地掌握其发音。
通过以上分析，我们可以理解六字真言不同读音的原因，并在实际学习和应用中尽量追求一致性。