《光环5：守护者》的剧情紧接《光环4》的结尾，讲述了士官长John-117在“下一个72小时”事件后的失踪，以及蓝色分队在UNSC中的行动。士官长开始怀疑自己之前所有的信念，他的命运成为剧情的核心。在游戏中，玩家将陪伴士官长和他的队友们，经历一系列紧张刺激的任务，同时揭开Cortana下落的谜团。
剧情的主要特点包括：
士官长的信念危机：
士官长在经历一系列事件后，开始对自己的信念产生怀疑。
蓝色分队的行动：
蓝色分队在UNSC中继续执行任务，寻找士官长的下落。
Cortana的线索：
游戏中穿插了寻找Cortana的线索，玩家需要解开谜题以追踪她的信号。
新角色和剧情发展：
游戏引入了新角色和剧情线，如Osiris Locke小队和冥王小队，丰富了游戏的世界观。
尽管《光环5》的剧情被认为有些混乱，但它在游戏性和角色发展方面仍然有其独特的魅力。士官长的传奇故事继续在这个庞大的宇宙中展开，玩家可以通过游戏、小说、电影和电视剧等多种媒介深入了解这个世界的背景和人物。