郑微最后拒绝了陈孝正的原因是多方面的，主要包括以下几点：
不甘心和不服气：
郑微不选择陈孝正是因为她感到不甘心和不服气。她怪陈孝正当初选择赴美留学而没有选择留下来，这种情绪使得她最终决定不和他在一起。
爱情观和人生经历：
郑微认为她和陈孝正之间的爱情层级不同，注定两人爱得很累，很难走到一起。她自己的妈妈和最好的朋友阮阮都因为爱情的悲惨命运而受到影响，这也影响了她的选择。
陈孝正的自卑和敏感：
陈孝正家境贫寒，从小十分自卑且敏感。他的这种性格使得他觉得自己配不上郑微，无法给她美好的未来。尽管郑微愿意和他一起吃苦，但陈孝正不忍心让她过苦日子，因此选择了离开。
被欺骗的感觉：
陈孝正为了梦想选择了出国，而郑微并不知情。当她得知陈孝正出国后，感到被欺骗，从而选择了和陈孝正分手。
林静的存在：
林静在郑微和陈孝正之间起到了重要的影响作用。他虽然不是最耀眼的存在，但他给予郑微温暖和依靠，使得郑微最终选择和他在一起。
综上所述，郑微拒绝陈孝正是由于她内心的不甘心、对爱情层级不同的认识、陈孝正的自卑和敏感以及被欺骗的感觉等多重因素共同作用的结果。