《穿越西元3000后》的大结局存在多个版本，以下是可能的结局：
叶冰瑶回到自己的时空并与威斯基成为男女朋友
在对抗红色精灵时，叶冰瑶的芯片失控，变成了时空隧道，她回到了自己的时空。威斯基也穿过隧道找到她，并与她共度了一天普通的男女朋友。最后，威斯基要回到未来，叶冰瑶决定一起回到未来。
叶冰瑶与葳斯基幸福生活在一起
叶冰瑶与葳斯基一起揭开了玲美的真面目，发现她的记忆被改过，成为了火星的间谍。在一场火星和地球的战争后，葳需要喝血，背离发现了并给了葳解药。葳带叶冰瑶回到四季城堡，再一次找到了极光雪莲，并向她求婚。
叶冰瑶恢复平静生活，与葳再无牵绊
叶冰瑶在经历了一系列冒险后，最终恢复了平静的生活，与葳再无牵绊。
叶冰瑶与葳斯基一起回到未来
叶冰瑶在对抗红色精灵时，芯片失控变成了时空隧道，她回到自己的时空。威斯基也穿过隧道找到她，并与她共度了一天。最后，两人决定一起回到未来。
开放式结局
叶冰瑶在喝醉后晕倒在亭子里，葳把她唤醒并告诉了她一切。两人一起揭开了玲美的真面目，并在战争结束后，葳需要喝血，背离发现了并给了葳解药。最后，葳带叶冰瑶回到四季城堡，再一次找到了极光雪莲，并向她求婚。但这个结局并没有明确说明两人最终是否在一起，属于一个开放式结局。
综上所述，《穿越西元3000后》的大结局存在多个版本，具体结局可能因版本不同而有所变化。建议您查看最新的漫画更新或官方公告以获取最准确的结局信息。