如果上学期没有填写综合素质评价系统，可以采取以下步骤进行补填：
联系班主任或学校管理员
首先，需要联系班主任或学校管理员，询问是否还有补填的机会和时间。如果学校或老师认为可以补填，他们会提供相应的指导和支持。
通过学校平台或系统补填
有些省市和学校可能有自己的综合素质评价系统，学生可以通过登录这些系统，在规定的期限内补充完善综合素质评价报告。例如，通过省普通高中学生综合素质评价信息管理平台，在规定时间内补充完善综合素质评价报告，报告须包括高中三年的相关材料，可采取系统直接填报办法。
准备相关材料
在补填过程中，需要准备相关的证明材料，如活动参与证明、成绩证明等，并按照系统要求上传这些材料。
注意时间限制
补填综合素质评价通常有明确的时间限制，因此需要尽快完成补填工作，以免影响综合素质评价档案和高考升学。
确认和提交
补填完成后，需要仔细检查并确认所有信息无误，然后提交综合素质评价报告。有些情况下可能需要经过班主任或学校管理员的审核和确认。
通过以上步骤，可以顺利完成上学期综合素质评价系统的补填工作。建议尽早联系班主任或学校管理员，获取具体的补填指引和帮助。