在电视剧《还珠格格》的结局中，小燕子和永琪最终选择离开皇宫，远走高飞，隐居云南大理。他们过上了没有规矩束缚的自由潇洒的生活，并且有了自己的孩子。尽管他们的生活不如以前奢华，但幸福无处不在。
具体来说，小燕子和永琪在离开皇宫后，选择隐居云南大理，他们的生活平淡而幸福。小燕子和晴儿还生育了几个孩子，他们讨论着家长里短和自家孩子的情况。皇帝后来南巡到云南，还化名“艾大师”去探望他们。小燕子和永琪在云南的生活是平凡而幸福的，他们开起了茶园，五阿哥也当了医生，每个人都得到了自己想要的。
因此，可以说小燕子的结局是非常幸福的，她与永琪一起过上了向往的自由生活，并且有了自己的家庭和孩子。