在电视剧《奋斗》中，向南最终选择杨晓芸而不是瑶瑶，主要基于以下几个原因：
责任感：
向南意识到杨晓芸对他的爱，并且在她下跪求他的时候，他感受到了强烈的责任感。他觉得他有责任让杨晓芸幸福，而与瑶瑶在一起，杨晓芸可能会感到阴影。
需要与依赖：
杨晓芸在情感上显得更为脆弱，需要向南的关怀和爱护。向南觉得杨晓芸更需要他，而瑶瑶作为一个独立、有能力的女性，并不需要他去照顾。
情感与回忆：
向南与杨晓芸之间有着更多的情感和回忆，他们共同经历了许多事情，这些经历让向南对杨晓芸有了更深的感情。
牺牲与付出：
杨晓芸为了家庭和向南做出了很多牺牲，包括卖掉自己的跑车、坐向南的小奥拓，甚至愿意给向南三次出轨的机会。这些行为让向南觉得杨晓芸是真心爱他的，也让他更加坚定地选择杨晓芸。
内心的选择：
向南在关键时刻选择了杨晓芸，这显示了他内心深处的真实想法和情感。他意识到，无论选择谁，都会对另一方造成伤害，但他最终选择了对自己至爱负责的道路。
综上所述，向南选择杨晓芸而不是瑶瑶，是因为他在杨晓芸身上看到了更多的需要和依赖，同时他也无法割舍与杨晓芸之间的深厚感情和回忆。他的选择更多是基于责任感和对杨晓芸的爱。