《阿飞正传》的结局是悲剧性的，阿飞（由梁朝伟饰演）在菲律宾的一列返乡火车上被人用枪打死。在电影的最后，阿飞与超仔（由刘德华饰演）在火车站相遇，并告诉超仔他永远不会忘记与苏丽珍在一起的那一分钟。随后，阿飞在一场打斗中身负重伤，最终在火车上结束了他的一生。
此外，影片中还有一个未完成的片段，梁朝伟饰演的阿飞穿着整齐的西装，正在认真修剪自己的指甲，然后走出房间。这个片段原本是作为续集的开头，但由于影片超支，最终没有被剪入正片。
综合以上信息，可以得出以下结论：
1. 阿飞在火车上被枪打死。
2. 影片中有一个未完成的片段，展示了阿飞在续集开头可能的样子。
3. 电影的结局留给观众深刻的印象，象征着阿飞寻找自我和爱情的最终归宿。