马皇后去世时，朱元璋确实非常悲痛，并且哭得很伤心。以下是相关文献中的记载：
《明史》记载：
马皇后去世后，朱元璋恸哭，并且从此不再立皇后，以表示对她的独特情感和地位的认可。
电视剧《朱元璋》：
在剧中，朱元璋在众人面前嚎啕大哭，甚至一夜须发皆白，他对儿子朱标说：“你娘死了，她怎么能死呢？那时的他根本就不是一个威严的皇帝，而是一个失去老伴的可怜人。”。
宗泐法师的预言：
在出殡当天，遇到大雨倾盆，宗泐法师安慰朱元璋说：“雨降天垂泪，雷鸣地举哀。西方诸佛子，同送马如来。”。
综合这些记载和描述，可以得出结论：马皇后去世时，朱元璋确实哭得很伤心，并且他的悲痛程度非常深，甚至因为悲痛而不再立皇后。