汤姆索亚是一个充满好奇心和冒险精神的小男孩。他的姨妈波莉总是拿他没办法，因为他总是能找到各种理由逃避做家务或者学校的作业。一天，汤姆遇到了一个可爱的女孩，名叫贝琪，他对她一见钟情，并且成功地赢得了她的心。
镇上还有一个孩子，名叫哈克贝利·费恩，他的家庭环境非常糟糕，父亲酗酒，父母总是打架。哈克因此离开了家，开始了自己的生活。尽管他看起来和社会格格不入，但他和汤姆却成了好朋友。
一天晚上，汤姆和哈克约定去墓地探险。在那里，他们意外地目睹了一起谋杀案。印第安·乔杀死了医生，并试图将罪名嫁祸给无辜的波特。汤姆和哈克非常害怕，但他们发誓要保守这个秘密。
波特被捕后，汤姆感到非常内疚，经常去看望他。与此同时，汤姆的生活也充满了不顺，贝琪不再理他，姨妈波莉也对他越来越严厉。汤姆感到自己被所有人忽视了。
最终，汤姆、哈克和另一个孩子一起乘小船去了一个荒岛。他们以为村民们会认为他们淹死了，于是决定在他们为汤姆和哈克举行葬礼时回来。当村民们发现他们还活着时，都感到非常惊讶。
夏天来临，汤姆越来越感到不安，因为法官即将对波特作出判决。最终，汤姆克服了恐惧，揭露了印第安·乔的罪行。然而，凶手还是逃走了。
后来，汤姆和哈克偶然发现了印第安·乔的藏宝，但他们不知道宝藏具体在哪里。在一次野餐活动中，哈克得知印第安·乔计划对道格拉斯寡妇下手，因为他曾经送印第安·乔进监狱。哈克及时通知了寡妇，阻止了悲剧的发生。但印第安·乔再次逃脱了。
最后，汤姆和贝琪在山洞里迷路了，他们再次遇到了印第安·乔。幸运的是，村民们及时找到了他们，并将印第安·乔封在了山洞里。当印第安·乔被发现时，他已经死在了里面。最终，恶人得到了应有的报应，汤姆和哈克也找到了他们梦寐以求的宝藏。