干部三科主要负责 市直党群部门和政府部门市管干部的任免工作。具体职责包括：
考察和任免：
负责考察党群系统、科教文卫部门、市国资委以及所属和归口管理的县处级企事业单位、市属高校的领导班子和市管干部，并提出职务任免、交流、待遇、退（离）休等方面的意见和建议。
后备干部管理：
负责上述单位处级后备干部、妇女干部、党外干部、少数民族干部的选拔、培养、使用和管理工作。
思想作风建设：
了解上述单位领导班子思想作风建设和民主生活会情况，提出工作建议。
协助管理：
协助有关部门对部分中央、省驻永单位的领导班子进行考察和管理，对领导班子的调整配备和干部职务任免等提出建议。
其他职责：
还包括对分工联系的法检系统、市政府工作部门（不含教育、卫生、国资）的市委管理的领导班子和领导干部进行考察考核和日常管理，提出工作建议。
这些职责确保了干部三科在市直党群和政府部门市管干部管理中的重要角色，旨在通过选拔、培养、考核和任免等手段，提升干部队伍的整体素质和能力，以更好地服务于组织的发展和目标。