重庆违停抓拍系统没有发短信提醒可能有以下几个原因：
电子眼系统工作机制
电子眼系统主要用于监控和记录交通违法行为，包括违章停车，但并非所有的违章行为都会立即触发短信提醒。短信提醒服务可能因地区、系统更新或维护等原因而暂时不可用。
短信提醒服务的限制
并非所有地区的交通管理系统都提供实时的违章短信提醒服务。即使提供了短信提醒服务，也可能因为车主未及时更新联系方式或系统错误而导致未能收到短信。
违停告知单审核过程
违停告知单开出后，需要经过后台两次审核研判，告知短信并不是实时发送。因此，车主可能在一段时间内收不到短信通知。
系统处理时间
违章停车的短信通知可能需要一定的时间，例如5~10个工作日，手机上才会收到短信。这是因为在贴了罚单之后，交警需要将罚单的存根手输入电脑里面，这时候才会有提醒显示违章信息。
申诉途径
如果车主违停没有收到短信通知，可以向当地公安机关提出申诉，要求撤销处罚或减少罚款数额。需要准备相关的证据材料，如电子抓拍记录、当时的路况视频等，以证明当时未收到短信通知。
综上所述，重庆违停抓拍系统没有发短信提醒可能是由于系统工作机制、短信提醒服务限制、违停告知单审核过程、系统处理时间或申诉途径等多种原因导致的。如果车主未收到短信通知，可以通过上述申诉途径进行申诉。